生物学系建有生物科学专业、科学教育专业、酿酒工程专业等三个本科专业，在生物科学一级学科下设微生物学、动物学、生物化学与分子生物学、生物修复等四个二级学科方向。以国家级特色专业、浙江省重点建设专业（生物科学）及浙江省新兴特色专业、绍兴市高校特色专业（酿酒工程）为依托，在微生物技术与绍兴酒研究、珍珠与经济水产动物增养殖、生态修复与水处理技术等研究方面取得突出成果并形成鲜明特色。建有浙江省生物学实验教学示范中心、国家黄酒工程技术研究中心分中心、绍兴市黄酒研究院、绍兴市农业(水产)公共科技服务平台等。

生物学系共有专任教师42人，其中正高14人、副高13人，90%以上专任教师具有海内外知名高校博士学位。浙江省万人计划青年拔尖人才1人，浙江省海外引才青年项目1人，浙江省教学名师1人，浙江省教坛新秀1人，浙江省中青年学科带头人2人，浙江省151人才2人，浙江省优秀科技特派员4人。

学系每年科研经费约400万元，发表SCI论文20余篇。

近五年承担各类科研项目60余项，到账科研经费2500余万元。发表SCI/EI收录期刊论文160余篇。学生在全国大学生生命科学竞赛、全国大学生数学建模竞赛、浙江省大学生“挑战杯”课外科技作品竞赛、浙江省大学生师范技能竞赛等科技竞赛中屡获佳绩，学生主持省级以上科研项目30项，发表论文50多篇。近年来，考研率持续上升，2022年生物学专业考研录取率达到71.43%，学院学生的初次就业率稳定在95%以上。

环境科学系下设环境科学专业，2019年列为绍兴市重点建设学科。现有专任教师23人，其中教授6人，副教授5人；有“长江学者”特聘教授1人，首席科学家1人；博士生导师4人，硕士生导师18人；具有博士学位教师占比95%。“绍兴市平原河网地区环境安全重点实验”为绍兴市重点实验室。“平原河网区域生态环境修复创新团队”为绍兴市重点创新团队。

拥有总价值超过3000多万元的各类仪器设备，实验教学及科研条件良好。建有虚拟现实创新教育实验中心，及环境监测、水污染控制技术、纳米材料开发、土壤营养与生态等专业实验室。获批全国首个生态环境部环境执法实训基地，建有浙江省生态与环境修复技术协会实训基地，以及20多家实践教学基地。

近五年承担各类科研项目30余项，到账科研经费1500余万元。发表SCI/EI收录期刊论文150余篇。近五年学生参加全国及省级学科竞赛获各级奖项30余项，发表SCI收录期刊论文13篇，国内期刊论文21篇，主持创新创业项目12项，考取国内外研究生29名。